Персидские силы расположились лагерем у Зелии (Zelia). Они имели возможность воспрепятствовать продвижению Александра через Троаду, заняв рубеж обороны по какой-либо из рек, текущих с севера в Мраморное море (Пропонтиду). Одна из них, Граник, обеспечивала удачную позицию для персов. Персидский царь Дарий III, находившийся сейчас далеко на востоке в своей столице Сузы, вверил армию в Малой Азии команде губернаторов его западных провинций. Помимо персидских войск им подчинялось и соединение греческих солдат-наемников под командованием Мемнона Родосца. Этот офицер уже доказал свои тактические таланты и организаторские способности в сражениях против македонских сил. Сейчас он привел с собой контингент примерно из 20 тысяч воинов. По численности его отряд приблизительно равнялся всей персидской коннице западных губернаторов. Однако у них практически не было пехоты (кроме греков-наемников). Вообще количественное соотношение пехоты и конницы в этой персидской армии было необычным: возникает ощущение, что персидская пехота еще не была полностью мобилизована. Возможно, она просто не успела прийти к полю боя при Гранике, поскольку во многих организационных решениях действия персов выглядят сильно запоздалыми.

Армия Александра приблизилась к Гранику в строю, который представлял собой переходную стадию от походной колонны к боевому развертыванию. Его главная ударная сила – тяжелая пехота, уже маршировала в двух параллельных колоннах с конницей, прикрывающей ее фланги. Обоз следовал позади. Под руководством офицера Гегелоха (Hegelochus) сводный отряд разведчиков из тяжелой кавалерии (сариссофоров) и 500 легковооруженных пехотинцев двигался впереди колонн, осуществляя разведку.
Македонская армия подходила к реке Граник, когда к царю прибыли посыльные от Гегелоха, сообщив, что враг обнаружен. Греки видели, что персы построились на противоположном достаточно крутом берегу реки. Подход к Гранику был достаточно просторным, чтобы Александр смог развернуть свою армию. Персы вели себя пассивно, позволив ему беспрепятственно перестроиться в боевой строй.
Второй по старшинству командир македонского войска Парменион согласно сохранившимся свидетельствам предлагал выждать – построить лагерь и дождаться следующего дня. Быстрая глубокая река и ее крутые берега были серьезным препятствием между двумя армиями, и если на этом берегу воины Александра могли легко принять бой, то, начав форсирование на противоположный берег, они выходили б в рассыпанных группах или в колоннах, что ставило подразделения под удар опасных контратак. Парменион подчеркивал, что македонцы превышают врага в численности пехоты, а следовательно, персы вряд ли рискнут форсировать ночью реку и нападать на их лагерь. Если бы македонцы дождались рассвета, то смогли бы форсировать реку в отдалении от персидской армии и атаковать персов с фланга вдоль реки.
Абсолютно все, что предлагал Парменион, было тактически верным продуманным решением. Но, как это бывало и в других случаях, Александр высокомерно отклонил эти разумные советы. Для него принципиальным был вопрос морального состояния войск: он боялся, что храбрость и доверие у македонцев пострадают, если, увидев врага, их командиры начнут строить укрепления и избегать сражения.
Некоторое время две армии стояли друг напротив друга, как бы раздумывая, кто первый начнет атаку. Понятно, что персы, занимавшие высокий берег реки, и не думали трогаться с места, наблюдая за действиями Александра, которого легко можно было различить в толпе, выделявшегося роскошной броней. Еще раз напомним, что на персидском военном совете предложение талантливого полководца грека-родосца Мемнона заманить Александра вглубь материка, разоряя оставленные области, и одновременно открыть боевые действия в тылу македонцев, в Греции – было решительно отклонено малоазийскими сатрапами. Они не желали, чтобы враг опустошал их владения, и поэтому решили дать Александру сражение незамедлительно. Александр так же не мог ждать ни дня. Даже если не говорить о моральном духе войск, было очевидно, что к персам идут пехотные подкрепления, и с каждым днем врагов будет больше и больше.